
ANALYSE ALLER GENE, DIE MIT IMMUNDEFEKTEN ASSOZIIERT WERDEN
Unser Panel für Immundefekte decken Erkrankungen des autoinflammatorischen und autoimmunen Spektrums (AID-Panels) sowie Gene für primären Immundefizienzen (PID-Panels) ab. Auch die Thymusfehlbildungen, bei denen die Reifung der T-Zellen gestört ist und die deshalb im TREC-SCID-Screening auffällig sein können, sind als Differentialdiagnose im diesem Panel enthalten. Während Blut- und Urinuntersuchungen eine wichtige diagnostische Vorstufe zur Aufstellung einer Verdachtsdiagnose sind, kann oft nur der Nachweis einer pathogenen genetischen Veränderung einen Verdacht definitiv bestätigen und eine eindeutige Diagnose stellen. Das Ergebnis der genetischen Testung kann damit entscheidend für das weiterführende klinische Patientenmanagement im Hinblick auf Impfungen, Medikation und Transplantation sein.
Das Diagnostik-Panel für Immundefekte umfasst 339 Gene. Alle diese Gene werden parallel sequenziert und die Gene interpretiert, die mit dem Phänotyp der Patientin oder des Patienten assoziiert sind. Unten finden Sie, neben allen Genen des Panels, unsere vorgeschlagenen Gen-Sets.
Für diagnostische Fragestellungen können die Gen-Sets einzeln oder in Kombination angefordert werden. Eine individuelle Genkombination ist ebenfalls möglich.
Bei Fragen wenden Sie sich bitte gern an unser Diagnostik-Support Team.
METHODE
Die Anreicherung der kodierenden Bereiche, sowie der angrenzenden Intronbereiche erfolgt mit einer Hybridization-in-Solution-Technologie. Hierbei wird die Auswahl der anzureichernden Bereiche getroffen und die Anreicherungs-Baits designt. Die Hochdurchsatz-Sequenzierung wird auf der Illumina NovaSeq-6000 Plattform durchgeführt. Mittels hausinterner Computercluster werden die Daten bioinformatisch aufbereitet. Anschließend wertet unser Team, bestehend aus Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern sowie Fachärztinnen und Fachärzten für Humangenetik, die Daten aus und erstellt einen medizinischen Befund.
MATERIAL & DAUER
Material:
- 1-2 ml EDTA-Blut oder 1-2 µg genomische DNA
- Einsendeformular inkl. schriftliche Einverständniserklärung nach GenDG
2-3 Wochen*
*Aufgrund der hohen Nachfrage und einer Vielzahl an eiligen und pränatalen Fällen, ist unsere Bearbeitungszeit aktuell etwas erhöht. Für eilige Proben beträgt unsere Bearbeitungszeit selbstverständlich weiterhin 2-3 Wochen.
Panelübersicht
Periodisches Fiebersyndrom mit/ohne Urtikaria
MEFV, MVK, TNFRSF1A, NLRP3, NTRK1, OTULIN, WDR1, NLRC4, NLRP12, PLCG2, F12 (c.859T>A) (10 Gene)
Vollständiges Gen-Set
F12 (c.859T>A), HTR1A, MEFV, MVK, NLRC4, NLRP12, NLRP3, NTRK1, OTULIN, PLCG2, RIPK1, SLC29A3, TNFRSF1A, WDR1 (14 Gene)
Leitsymptom Inflammation der Gelenke oder Knochen
NOD2, PSTPIP1, TNFAIP3, CCN6, IL1RN, LPIN2 (6 Gene)
Leitsymptom Inflammation der Haut
CARD14, PSTPIP1, IL1RN, IL36RN, OTULIN, CARD11, NLRP1, POMP, PSMA3, PSMB8, PSMB4, PSMB9, HAVCR2, LPIN2, ADAM17, AP1S3 (16 Gene)
Inflammation mit Vaskulitis
ADA2, STING1, TNFAIP3, ARPC1B, NFKB1 (5 Gene)
Vollständiges Gen-Set
ADA2, ADAM17, AP1S3, ARPC1B, CARD11, CARD14, CCN6, HAVCR2, IL1RN, IL36RN, LACC1, LPIN2, NFKB1, NLRP1, NOD2, OTULIN, POMP, PSMA3, PSMB4, PSMB8, PSMB9, PSTPIP1, STING1, TNFAIP3, UBA1 (25 Gene)
IL10RA, IL10RB, IL10, IL21R, IL21, TTC7A, XIAP, ZBTB24, NLRC4, CYBA, CYBB, NCF2, NCF4, CARMIL2, FOXP3, BACH2, STAT3, NCF1 (c.75_76delGT) (17 Gene)
ADAM17, BACH2, CARMIL2, CD55, CTLA4, CYBA, CYBB, EGFR, EPCAM, FOXP3, GUCY2C, HSPA1L, IL10, IL10RA, IL10RB, IL21, IL21R, IL2RB, LRBA, NCF1 (c.75_76delGT), NCF2, NCF4, NFKB1, NLRC4, PLVAP, RIPK1, SKIV2L, STAT3, TGFB1, TTC37, TTC7A, XIAP, ZBTB24 (33 Gene)
PRF1, UNC13D, STX11, STXBP2, NLRC4, AP3B1, SLC7A7, GATA2, SH2D1A, XIAP, LYST (11 Gene)
AP3B1, CD27, CD48, GATA2, HAVCR2, ITK, LIPA, LYST, MAGT1, NCKAP1L, NLRC4, PIK3CG, PRF1, RAB27A, RC3H1, SH2D1A, SLC7A7, STX11, STXBP2, UNC13D, XIAP (21 Gene)
FAS, FASLG, CASP10, CASP8, PRKCD, IL2RA, CTLA4, KRAS, FADD, STAT3, STAT1, CARD11, DEF6, RELA, NFKB1, LRBA (16 Gene)
CD27, CD70, ITK, XIAP, SH2D1A, MAGT1, TNFRSF9, RASGRP1, NFKB1, IL2RB, STK4 (11 Gene)
CARD11, CASP10, CASP8, CD27, CD70, CDC42, CTLA4, DEF6, FADD, FAS, FASLG, IL2RA, IL2RB, ITK, KRAS, LRBA, MAGT1, NCKAP1L, NEIL3, NFKB1, NRAS, PIK3CD, PIK3R1, PRKCD, RASGRP1, RELA, SH2D1A, SOCS1, STAT1, STAT3, STK4, TNFRSF9, XIAP (33 Gene)
FOXP3, IL2RA, IL2RB, IL10, IL10RA, IL10RB, DOCK8, STAT5B, STAT3, STAT1, CTLA4, PIK3CD, PIK3R1 (13 Gene)
BACH2, CARMIL2, CTLA4, DOCK8, FAS, FASLG, FOXP3, IL10, IL10RA, IL10RB, IL2RA, IL2RB, LRBA, MALT1, PIK3CD, PIK3R1, STAT1, STAT3, STAT5B, TGFB1, TTC37, TTC7A (22 Gene)
PSMB8, PSMB4, PSMA3, POMP, PSMB9, PSMB10 (6 Gene)
C1QA, C1QB, C1QC, C2, C3, TREX1, STING1, C1R, C1S, PRKCD, SAMHD1, DNASE1L3, DNASE1 (13 Gene)
ADAR, IFIH1, OCLN, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RNU7-1, SAMHD1, TREX1, ISG15 (10 Gene)
ADAR, C1QA, C1QB, C1QC, C1R, C1S, C2, C3, DNASE1, DNASE1L3, IFIH1, ISG15, POMP, PRKCD, PSMA3, PSMB10, PSMB4, PSMB8, PSMB9, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RNU7-1, SAMHD1, STAT2, STING1, TREX1 (27 Gene)
ADA2, AIRE, ARPC1B, C2orf69, CDC42, ITCH, NFKB1, RBCK1, RNF31, SLC29A3, STING1, TRNT1 (12 Gene)
CD40LG, AICDA, CD40, UNG, PIK3CD, PIK3R1, ATM, SH3KBP1, NFKBIA (9 Gene)
PIK3CD, PIK3R1, PTEN (3 Gene)
TNFRSF13B, NFKB2, NFKB1, IKZF1, CR2, CD19, CD81, PIK3CD, PIK3R1, LRBA (10 Gene)
BTK, TCF3, IGLL1, CD79A, CD79B, BLNK, PIK3R1, SLC39A7, PLCG2 (9 Gene)
ADA2, AICDA, ARHGEF1, ATM, ATP6AP1, BLNK, BTK, CD19, CD40, CD40LG, CD79A, CD79B, CD81, CR2, CXCR4, FNIP1, ICOS, ICOSLG, IGLL1, IKBKB, IKZF1, IRF2BP2, LRBA, MS4A1, NFKB1, NFKB2, NFKBIA, PIK3CD, PIK3R1, PLCG2, PTEN, RAC2, SEC61A1, SH3KBP1, SLC39A7, TCF3, TNFRSF13B, TOP2B, UNG, VAV1 (40 Gene)
ADA, AK2, DCLRE1C, RAG1, RAG2, PRKDC, RAC2 (7 Gene)
CD247, CD3D, CD3E, IL2RG, IL7R, JAK3, LAT, PTPRC (8 Gene)
LIG4, NHEJ1, PGM3, PNP, CHD7, FOXN1, FOXI3, LIG1, PAX1 (9 Gene)
SCID-Panel bei auffälligem Neugeborenen-TREC-Screening
ADA, AK2, ATM, BCL11B, CD247, CD3D, CD3E, CD3G, CHD7, DCLRE1C, FOXI3, FOXN1, IL2RG, IL7R, JAK3, LAT, LCP2, LIG1, LIG4, MSN, MTHFD1, MTR, NHEJ1, PAX1, PGM3, PNP, PRKDC, PTPRC, RAC2, RAG1, RAG2, RMRP, RPSA, SLC46A1, TBX1 (35 Gene)
DOCK2, ORAI1, STIM1, CARD11, CD3G, IKBKB, IL2RA, IL2RG, PIK3CD, RASGRP1, FCHO1, LAT (12 Gene)
(MHC Klasse I Defizienz und DD)
B2M, TAP1, TAP2, TAPBP, ZAP70, CD8A (6 Gene)
(MHC Klasse II Defizienz und DD)
CIITA, MAGT1, RFX5, RFXANK, RFXAP, STK4, LCK (7 Gene)
B2M, CARD11, CARMIL2, CD27, CD3E, CD3G, CD8A, CIITA, COPG1, CTPS1, DOCK2, FCHO1, ICOS, IKBKB, IL21R, IL2RA, IL2RB, IL2RG, LAT, LCK, LCP2, MAGT1, MALT1, MAP3K14, MSN, ORAI1, PIK3CD, RASGRP1, RELB, RFX5, RFXANK, RFXAP, RIPK1, STIM1, STK4, TAP1, TAP2, TAPBP, TFRC, ZAP70 (40 Gene)
ARPC1B, CARD11, DOCK8, DSG1, ERBIN, FOXP3, IL6ST, PGM3, SPINK5, STAT3, STAT5B, TYK2, ZNF341 (13 Gene)
HELLS, DNMT3B, ZBTB24, CDCA7 (4 Gene)
TBX1, FOXI3, FOXN1, PAX1, TBX2, CHD7, SEMA3E, SMARCAL1 (8 Gene)
CDCA7, CHD7, CHUK, DNMT3B, EPG5, FOXI3, FOXN1, HELLS, PAX1, POLD1, POLD2, POLE, POLE2, SEMA3E, SMARCAL1, SP110, TBX1, TBX2, ZBTB24 (19 Gene)
Komplementdefekt mit vordergründiger Autoimmunität
C1QA, C1QB, C1QC, C2, C3, C1R, C1S (7 Gene)
Komplementdefekt mit schwerer Infektneigung
C7, C5, C8A, C8B, C6, CFI, CFH, CFP, CFD, CFB, C3 (11 Gene)
Defekt des Lectinwegs
MBL2, MASP1, MASP2, FCN3 (4 Gene)
Vollständiges Gen-Set
C1QA, C1QB, C1QC, C1R, C1S, C2, C3, C5, C6, C7, C8A, C8B, CFB, CFD, CFH, CFI, CFP, FCN3, MASP1, MASP2, MBL2 (21 Gene)
Neutropenie
ELANE, HAX1, GFI1, G6PC3, VPS45, WAS, JAGN1, CSF3R, GINS1, CLPB, SRP54, SMARCD2, TAZ, CD40, CD40LG, WIPF1, USB1, CXCR2, CXCR4, ADA2, GATA1 (21 Gene)
Shwachman-Diamond-Syndrom
SBDS, SRP54, EFL1, DNAJC21 (4 Gene)
Vollständiges Gen-Set
ADA2, CD40, CD40LG, CLPB, CSF3R, CXCR2, CXCR4, DNAJC21, EFL1, ELANE, G6PC3, GATA1, GATA2, GFI1, GINS1, HAX1, JAGN1, SBDS, SMARCD2, SRP54, TAZ, TCIRG1, USB1, VPS45, WAS, WIPF1 (26 Gene)
CYBA, CYBB, CYBC1, G6PD, MPO, NCF1 (c.75_76delGT), NCF2, NCF4 (8 Gene)
TAZ, SMARCD2, LAMTOR2, CLPB, RMRP, VPS13B (6 Gene)
CXCR2, CXCR4, CFTR, FERMT3, ITGB2, RAC2, SLC35C1, WDR1 (8 Gene)
CEBPE, CFTR, CLPB, CXCR2, CXCR4, FERMT3, ITGB2, LAMTOR2, MRTFA, RAC2, RMRP, SLC35C1, SMARCD2, TAZ, VPS13B, WDR1 (16 Gene)
Chronische mukokutane Candidiasis und Anfälligkeit für weitere Pilzinfektionen
AIRE, CARD9, CLEC7A, IL12B, IL12RB1, IL17F, IL17RA, IL17RC, MAPK8, RORC, STAT1, STAT3, TRAF3IP2 (13 Gene)
CYBB, GATA2, IFNG, IFNGR1, IFNGR2, IL12B, IL12RB1, IL12RB2, IL23R, IRAK4, IRF8, ISG15, JAK1, RORC, SPPL2A, STAT1, TBX21, TYK2 (18 Gene)
Infektneigung: virale Infektionen
CXCR4, GATA2, GINS1, IFNAR2, IRF7, IRF8, IRF9, MCM4, STAT2, PIK3CD, TYK2 (11 Gene)
Herpes-simplex Enzephalitis
TLR3, RANBP2, TICAM1, IRF3, UNC93B1, TRAF3, TBK1, DBR1, STAT1 (9 Gene)
Vollständiges Gen-Set
CXCR4, DBR1, GATA2, GINS1, IFNAR1, IFNAR2, IRF3, IRF7, IRF8, IRF9, MCM10, MCM4, NOS2, PIK3CD, POLR3A, POLR3C, POLR3E, POLR3F, RANBP2, RTEL1, SNORA31, STAT1, STAT2, TBK1, TICAM1, TLR3, TRAF3, TYK2, UNC93B1 (29 Gene)
CXCR4, DOCK8, GATA2, STK4, CD4, CIB1, TMC6, TMC8, RHOH, IL7, CARMIL2, NFKBIA, TAOK2 (13 Gene)
BCL10, CARD11, IKBKB, MALT1, MAP3K14, NFKB2, NFKBIA, RBCK1, REL, RELA, RELB, RIPK1, RNF31, TICAM1, TRAF3 (15 Gene)